重庆市农业科学院是以原重庆市农业科学研究所、市果树研究所、市作物研究所、市茶叶研究所、市农业机械研究所为基础，由重庆市人民政府于2005年12月批准成立的正厅局级全民所有制公益型农业科研事业单位。