新疆现代职业技术学院始建于1995年，2001年经自治区教育厅审批更名为新疆医科专修学院，2004年经自治区人民政府批准报国家教育部备案的具有独立颁发国家文凭资格的综合性高等院校，学院的成立实现了自治区民办高等教育零的突破，新疆从此告别了没有民办高校的历史。